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Table 1 Methylation-driven genes

From: Identification of methylation-driven genes related to the prognosis of papillary renal cell carcinoma: a study based on The Cancer Genome Atlas

Gene

Normal mean

Tumor mean

LogFC

P value

Cor

Cor P value

AHNAK2

0.80029

0.416044

− 0.94379

5.37E − 24

− 0.57876

6.70E − 26

HRH1

0.544689

0.294975

− 0.88484

5.82E − 24

− 0.38988

2.22E − 11

HRG

0.522776

0.789381

0.59453

2.59E − 23

− 0.33909

8.47E − 09

JPH2

0.235062

0.112414

−1.06422

2.89E − 22

− 0.37387

1.62E − 10

SLC4A9

0.479872

0.713725

0.572717

6.78E − 22

− 0.35973

8.57E − 10

APOL1

0.477775

0.267652

− 0.83597

2.32E − 21

− 0.34269

5.75E − 09

CASP1

0.396953

0.210789

− 0.91317

2.67E − 20

− 0.49442

2.69E − 18

GGT6

0.426959

0.665606

0.64057

3.09E − 20

− 0.33194

1.80E − 08

RDH5

0.638209

0.320082

− 0.99559

3.66E − 20

− 0.42865

1.13E − 13

CD68

0.530169

0.367352

− 0.52929

3.72E − 20

− 0.35661

1.22E − 09

GCKR

0.765666

0.540347

− 0.50283

6.32E − 19

− 0.35733

1.13E − 09

APOBEC3C

0.185781

0.082609

− 1.16923

1.06E − 18

− 0.60805

4.30E − 29

LINC00944

0.831985

0.530775

− 0.64846

1.06E − 18

− 0.46232

6.47E − 16

C19orf33

0.437952

0.215921

− 1.02027

4.00E − 18

− 0.3937

1.36E − 11

CMTM3

0.342488

0.143439

− 1.25562

6.58E − 17

− 0.39415

1.28E − 11

ADAM28

0.74307

0.42393

− 0.80967

2.72E − 16

− 0.64063

4.68E − 33

HHLA2

0.662209

0.341074

− 0.9572

5.35E − 16

− 0.47839

4.46E − 17

HOXD9

0.480952

0.68171

0.503265

7.76E − 16

− 0.42839

1.18E − 13

HOXA10-AS

0.15125

0.098828

− 0.61395

1.25E − 15

− 0.45093

3.96E − 15

TTTY15

0.063782

0.192718

1.595264

1.47E − 14

− 0.38672

3.31E − 11

ZNF233

0.221283

0.434761

0.974332

8.90E − 14

− 0.4618

7.04E − 16

HOXD3

0.419182

0.655494

0.645008

9.57E − 14

− 0.33546

1.25E − 08

GIPC2

0.379961

0.229483

− 0.72747

1.00E − 13

− 0.5739

2.11E − 25

KDM5D

0.05324

0.237807

2.159199

1.34E − 13

− 0.32883

2.49E − 08

HSD17B14

0.303245

0.525014

0.791874

7.49E − 13

− 0.65209

1.45E − 34

SLC16A5

0.305615

0.45648

0.578838

1.11E − 10

− 0.61938

2.03E − 30

TMEM71

0.591421

0.308036

− 0.94109

1.60E − 10

− 0.65122

1.89E − 34

GYPC

0.310257

0.213077

− 0.54209

9.91E − 10

− 0.53728

6.78E − 22

IL12RB2

0.504344

0.315692

− 0.67589

1.25E − 08

− 0.50024

9.33E − 19

EIF1AY

0.108578

0.182552

0.74958

1.90E − 06

− 0.40683

2.40E − 12

PLA2G16

0.053717

0.088753

0.724419

3.68E − 06

− 0.36133

7.13E − 10