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Table 1 Methylation-driven genes

From: Identification of methylation-driven genes related to the prognosis of papillary renal cell carcinoma: a study based on The Cancer Genome Atlas

Gene Normal mean Tumor mean LogFC P value Cor Cor P value
AHNAK2 0.80029 0.416044 − 0.94379 5.37E − 24 − 0.57876 6.70E − 26
HRH1 0.544689 0.294975 − 0.88484 5.82E − 24 − 0.38988 2.22E − 11
HRG 0.522776 0.789381 0.59453 2.59E − 23 − 0.33909 8.47E − 09
JPH2 0.235062 0.112414 −1.06422 2.89E − 22 − 0.37387 1.62E − 10
SLC4A9 0.479872 0.713725 0.572717 6.78E − 22 − 0.35973 8.57E − 10
APOL1 0.477775 0.267652 − 0.83597 2.32E − 21 − 0.34269 5.75E − 09
CASP1 0.396953 0.210789 − 0.91317 2.67E − 20 − 0.49442 2.69E − 18
GGT6 0.426959 0.665606 0.64057 3.09E − 20 − 0.33194 1.80E − 08
RDH5 0.638209 0.320082 − 0.99559 3.66E − 20 − 0.42865 1.13E − 13
CD68 0.530169 0.367352 − 0.52929 3.72E − 20 − 0.35661 1.22E − 09
GCKR 0.765666 0.540347 − 0.50283 6.32E − 19 − 0.35733 1.13E − 09
APOBEC3C 0.185781 0.082609 − 1.16923 1.06E − 18 − 0.60805 4.30E − 29
LINC00944 0.831985 0.530775 − 0.64846 1.06E − 18 − 0.46232 6.47E − 16
C19orf33 0.437952 0.215921 − 1.02027 4.00E − 18 − 0.3937 1.36E − 11
CMTM3 0.342488 0.143439 − 1.25562 6.58E − 17 − 0.39415 1.28E − 11
ADAM28 0.74307 0.42393 − 0.80967 2.72E − 16 − 0.64063 4.68E − 33
HHLA2 0.662209 0.341074 − 0.9572 5.35E − 16 − 0.47839 4.46E − 17
HOXD9 0.480952 0.68171 0.503265 7.76E − 16 − 0.42839 1.18E − 13
HOXA10-AS 0.15125 0.098828 − 0.61395 1.25E − 15 − 0.45093 3.96E − 15
TTTY15 0.063782 0.192718 1.595264 1.47E − 14 − 0.38672 3.31E − 11
ZNF233 0.221283 0.434761 0.974332 8.90E − 14 − 0.4618 7.04E − 16
HOXD3 0.419182 0.655494 0.645008 9.57E − 14 − 0.33546 1.25E − 08
GIPC2 0.379961 0.229483 − 0.72747 1.00E − 13 − 0.5739 2.11E − 25
KDM5D 0.05324 0.237807 2.159199 1.34E − 13 − 0.32883 2.49E − 08
HSD17B14 0.303245 0.525014 0.791874 7.49E − 13 − 0.65209 1.45E − 34
SLC16A5 0.305615 0.45648 0.578838 1.11E − 10 − 0.61938 2.03E − 30
TMEM71 0.591421 0.308036 − 0.94109 1.60E − 10 − 0.65122 1.89E − 34
GYPC 0.310257 0.213077 − 0.54209 9.91E − 10 − 0.53728 6.78E − 22
IL12RB2 0.504344 0.315692 − 0.67589 1.25E − 08 − 0.50024 9.33E − 19
EIF1AY 0.108578 0.182552 0.74958 1.90E − 06 − 0.40683 2.40E − 12
PLA2G16 0.053717 0.088753 0.724419 3.68E − 06 − 0.36133 7.13E − 10