Description
|
Gene markers
|
SKCM
|
---|
None
|
Purity
|
---|
Cor
|
P
|
Cor
|
P
|
---|
CD8 + T cell
|
CD8A
|
− 0.012
|
0.794
|
− 0.016
|
0.738
|
CD8B
|
− 0.022
|
0.636
|
− 0.028
|
0.553
|
B cell
|
CD19
|
− 0.005
|
0.907
|
− 0.011
|
0.810
|
CD79A
|
− 0.084
|
0.068
|
− 0.086
|
0.066
|
T cell (general)
|
CD3D
|
− 0.048
|
0.302
|
− 0.053
|
0.254
|
CD3E
|
− 0.065
|
0.158
|
− 0.069
|
0.140
|
CD2
|
− 0.029
|
0.523
|
− 0.035
|
0.456
|
Monocyte
|
CD86
|
0.094
|
0.042
|
0.094
|
0.044
|
CD14
|
0.028
|
0.547
|
0.038
|
0.421
|
CD115(CSF1R)
|
0.065
|
0.162
|
0.070
|
0.133
|
TAM
|
CCL2
|
0.063
|
0.171
|
0.068
|
0.146
|
CD68
|
0.081
|
0.078
|
0.067
|
0.152
|
IL10
|
0.165
|
< 0.001
|
0.167
|
< 0.001
|
M1 Macrophage
|
INOS(NOS2)
|
− 0.015
|
0.743
|
− 0.009
|
0.844
|
IRF5
|
0.020
|
0.671
|
0.027
|
0.571
|
COX2(PTGS2)
|
0.148
|
0.001
|
0.151
|
0.001
|
CD40
|
0.019
|
0.676
|
0.025
|
0.594
|
M2 Macrophage
|
CD206(MRC1)
|
0.165
|
< 0.001
|
0.177
|
< 0.001
|
CD163
|
0.180
|
< 0.001
|
0.189
|
< 0.001
|
VSIG4
|
0.099
|
0.031
|
0.109
|
0.020
|
CD200R1
|
0.147
|
0.001
|
0.146
|
0.002
|
MS4A4A
|
0.130
|
0.005
|
0.135
|
0.004
|
Natural killer cell
|
KIR3DL1
|
− 0.055
|
0.230
|
− 0.063
|
0.175
|
KIR3DL2
|
− 0.080
|
0.083
|
− 0.076
|
0.104
|
KIR3DL3
|
− 0.122
|
0.008
|
− 0.125
|
0.008
|
KIR2DS4
|
− 0.122
|
0.008
|
− 0.084
|
0.071
|
- Bold values represent significantly different (P < 0.05)