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Table 3 Description of cCGH chromosome alterations in IPO43 cell line

From: Establishment and characterization of a novel ovarian high-grade serous carcinoma cell line—IPO43

 

Gain of entire chromosomes/partial gains of chromosome regions

Loss of entire chromosomes/partial losses of chromosome regions

Cells from ascitic fluid

20/

1p34.3-q23, 1q31-q32.1, 1q32.3-q44, p25-p11.2, 3p12-q29, 4q28-q35, 5p15.3-p13, 7p22-q34, 8p21-q24.3 with amplification 8q11.2-q23, 11p14-p11.2, 12p12-p11.2, 13q21-q31, 14q11.2-q13, 17q24-q25, 18p11.3-p11.2, 18q12, 19p13.3-q13.2 with amplification 19q12-q13.1

9, 15, 16, X/

3p24-p14, 4p16-q28, 5q11.2-q31, 6p22-p12, 11p15, 11q22-q25, 13q32-q34, 17p13-q21, 18q21.3-q23, 19q13.3-q13.4, 22q11.2-q13

Cells passage twenty (p20)

7, 12, 20/

1p36.3-q23, 1q32-q44, 2p25-q13, 2q21.1, 2q24-q32, 3p12-q29, 4q28-q35, 5p15.3-p13, 8q11.2-q24.3, 11q13-q14, 13q21-q31, 14q11.2-q21, 17q22-q25, 18p11.3, 19p13.3-q13.2 with amplification of 19q12-19q13.1

9, 15, X/

1q25-q31, 3p23-p21, 4p16-q27, 5q11.2-q31.1, 6q21-q26, 8p23-p12, 10q11.2-q26, 11q23.3-q25, 13q32-q34, 17p12-q21.3, 22q12-q13

Cells passage forty-two (p42)

20/

1p36.1-p31, 1q22-q23, 1q41-q42, 2p25-p21, 3q13.1-q29, 4q28-q35, 5p15.3-p13, 5q32, 7p22-q31, 8q13-q24.1, 9q22-q31, 10p13-p12, 14q11.2-q13, 17q22, 19p13.1-q13.1 with amplification of 19q12-19q13.1, Xq21.3-q25

15, 18/

1q31.1, 3p26-p13, 4p16-q27, 5q11.2-q22, 6p21.3-p12, 7q35-q36, 8p23-p12, 9p24-p13, 17p13-q21.1, 19q13.3, 22q12-q13, Xp22.3-q21.3, Xq25-q28